В разгар Холодной войны Naked Snake – человек, который впоследствии станет известен как Big Boss, – проникает на территорию Советского Союза, чтобы вывезти оттуда учёного-перебежчика по фамилии Sokolov. Однако его миссия терпит крах: наставница Snake'a, The Boss, – женщина-солдат, которую считают создательницей сил спецназначения, – предаёт его, и Sokolov оказывается в плену у полковника Volgin'а из GRU.

Неделю спустя Snake снова отправляется на советскую землю, чтобы вызволить Sokolov'а и устранить The Boss'а – эта операция станет началом новой легенды, вписанной в неумолимый ход истории.

Сделавшие оригинальную игру сенсацией история, персонажи, актёры озвучивания, игровой процесс и музыка возвращаются – теперь в версии для современных консолей. Этот эволюционный скачок вдохнул новую жизнь в каждую сцену и перестроил каждый уголок игрового мира.